期刊
TROPICAL MEDICINE & INTERNATIONAL HEALTH
卷 23, 期 9, 页码 992-1001出版社
WILEY
DOI: 10.1111/tmi.13117
关键词
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP); Schistosoma haematobium; diagnostic accuracy; microscopy; microhaematuria; Angola; amplification isotherme a mediation par boucle (LAMP); Schistosoma haematobium; precision diagnostique; microscopie; micro hematurie; Angola
资金
- Mundo Sano Foundation
- Institute of Health Carlos III, ISCIII, Spain
- European Union - FEDER (Fondo Europeo de Desarrollo Regional) 'Una manera de hacer Europa' [RICET RD16/0027/0018, DTS16/00207, PI16/01784]
ObjectiveTo evaluate the performance of Rapid-Heat LAMPellet assay in field conditions for diagnosis of urogenital schistosomiasis in an endemic area in Cubal, Angola, and to assess the reproducibility in a reference laboratory. MethodsA total of 172 urine samples from school-age children were tested for microhaematuria, microscopic detection of Schistosoma haematobium eggs and LAMP for DNA detection. Urine samples were stored in a basic equipped laboratory. Field-LAMP tests were performed with and without prior DNA extraction from urine samples, and the results were read by turbidity and by colour change. When field procedures were finished, samples were sent to a reference laboratory to be reanalysed by LAMP. ResultsA total of 83 of 172 (48.3%) were positive for microhaematuria, 87/172 (50.6%) were microscopy-positive for S.haematobium eggs detection, and 127/172 (73.8%) showed LAMP-positive results for detecting S.haematobium using purified DNA and 109/172 (63.4%) without prior DNA extraction. MacNemar's test showed a statistical significant relation between LAMP results and microscopy-detected S.haematobium infections and microhaematuria (P<0.001 in both cases), respectively. When samples of purified DNA were reanalysed in a reference laboratory in Spain using the same LAMP methodology, the overall reproducibility achieved 72.1%. ConclusionsThe ease of use, simplicity and feasibility demonstrated by LAMP assay in field conditions together with the acceptable level of reproducibility achieved in a reference laboratory support the use of LAMP assay as an effective test for molecular diagnosis of urogenital schistosomiasis in endemic remote areas. ObjectifEvaluer la performance du test Rapid-Heat LAMPellet dans des conditions de terrain pour le diagnostic de la schistosomiase urogenitale dans une zone endemique a Cubal, en Angola, et evaluer sa reproductibilite dans un laboratoire de reference. MethodesAu total 172 echantillons d'urine d'enfants d'age scolaire ont ete testes pour la micro hematurie, la detection microscopique des OEufs de S. haematobium et LAMP pour la detection de l'ADN. Des echantillons d'urine ont ete stockes dans un laboratoire equipe de base. Des tests LAMP de terrain ont ete effectues avec et sans extraction prealable d'ADN a partir d'echantillons d'urine et les resultats ont ete lus par la mesure de la turbidite et du changement de couleur. Lorsque les procedures de terrain ont ete achevees, les echantillons ont ete envoyes dans un laboratoire de reference pour etre re-analyses par LAMP. Resultats83 des 172 (48.3%) echantillons etaient positifs pour la micro hematurie, 87/172 (50.6%) etaient positifs par la microscopie pour la detection des OEufs de S. haematobium et 127/172 (73.8%) ont montre des resultats positifs pour la detection de S. haematobium avec extraction prealable d'ADN et 109/172 (63.4%) etaient positifs sans extraction d'ADN. Le test de MacNemar a montre une association statistiquement significative entre les resultats du LAMP et de la detection microscopique des infections a S. haematobium et la micro hematurie (p<0.001 dans les deux cas). Lorsque des echantillons d'extraits d'ADN ont ete re-analyses dans un laboratoire de reference en Espagne en utilisant la meme methode LAMP, la reproductibilite globale etait de 72.1%. ConclusionsLa facilite d'utilisation, la simplicite et la faisabilite du test LAMP dans des conditions de terrain ainsi que le niveau acceptable de reproductibilite obtenu dans un laboratoire de reference recommandent son utilisation pour le diagnostic moleculaire de la schistosomiase urogenitale dans les regions endemiques reculees.
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